Штраф в размере 1% будет рассчитываться от всей сметной стоимости (включая оборудование и материал), или только из стоимости работ

Однозначно ответить на поставленный вопрос не представляется возможным.

При толковании договоров суд поочередно использует различные методы, от наиболее приоритетного к дополнительным. В первую очередь суд последовательно применит методы, которые установлены законом (ст. 431 ГК РФ):

1)   буквальное (грамматическое) толкование. Это приоритетный метод, он дает самые предсказуемые результаты, поэтому на него удобнее ориентироваться и сторонам при составлении договора, и третьим лицам при оценке его условий (например, регоргану). Суд принимает во внимание буквальное значение слов и выражений, которые содержатся в тексте конкретного условия договора. При необходимости он опирается на словарные и общепринятые, в том числе в деловом обороте, значения;

Пример буквального толкования

Генподрядчик обратился в суд с иском о понуждении субподрядчика предоставить ему исполнительную документацию на выполненные работы. Суд, толкуя спорное условие договора, установил, что по нему субподрядчик обязан от имени генподрядчика предоставить спорную документацию напрямую заказчику, а не генподрядчику, и отказал в иске (Постановление ФАС Московского округа от 28.06.2012 по делу N А40-73922/11-50-610).

2)   системное (логическое) толкование. Этот метод используется, если не дал результата предыдущий и буквальное значение условия установить не удалось. В таком случае суд сопоставляет спорное условие с другими условиями договора и его смыслом в целом.

Словосочетание «номинированные материалы», по нашему мнению, означает «специально обозначенные, поименованные». Являются ли номинированные материалы давальческими должно быть определено договором. Пример решения суда с применением словосочетания «номинированные материалы» прилагаем.